Congreso Regional: es el órgano supremo de representación de UPA-UCE Extremadura. Cada cuatro años se celebra un Congreso Regional Ordinario.

Funciones:

• Establecer las grandes líneas generales de la política sindical de la organización.
• Elegir a los miembros de la Comisión Ejecutiva Regional, la Comisión de Control y los representantes de UPA-UCE Extremadura en el Comité Regional de UGT- Extremadura. Además de elegir los miembros del Comité Federal de UPA.

El Comité Regional es el órgano máximo de la Organización entre Congresos Regionales. Se reúnen dos veces al año con carácter ordinario.

La Comisión Ejecutiva Regional es el máximo órgano de gobierno permanente de UPA-UCE Extremadura y representa a la organización en los términos más amplios, tanto a efecto internos como externos. La Comisión Ejecutiva se reúne mensualmente y es elegida por el Congreso Regional.

Miembros elegidos en el 5º Congreso Regional de UPA-UCE celebrado el 27 y 28 de noviembre de 2010 en Mérida:

- Secretario General. Ignacio Huertas de la Peña.
- Vicesecretaria General. María Antonia Alcalá Jiménez.
- Secretario de Organización y Administración. Maximiano Alcón Aparicio.
- Secretario de Acción Sindical y Agricultura. José Cruz Llanos.
- Secretario de Ganadería y Olivar. Antonio Prieto Risco.
- Secretaria del Vino. Catalina García Reyes.
- Secretario Ejecutivo. Jesús Jiménez del Río.
- Secretaria Ejecutiva. Mª Sol Delgado Bertol.
- Secretario Ejecutivo. Óscar Llanos Pizarro.
- Secretaria Ejecutiva. Ana Isabel Jiménez López.
- Secretario Ejecutivo. Daniel Rodríguez Jiménez.

Comisión de Seguimiento Económico: es el órgano que supervisa la contabilidad de la Organización, verifica la administración de los medios económicos y comprueba que su uso se ajuste a los criterios y decisiones de sus órganos de dirección. Compuesta por los siguientes miembros:

- Antonio Sánchez Gallego.
- Vicente Andrades Pérez.
- Hilario Miguel Iglesias.
- Antonio Villafaina Moriche.
- Víctor Bardón Cuéllar.